Bio-informatique

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Le plateau Bio-Informatique propose les analyses des données issus des nouvelles générations de séquençage (Illumina et Nanopore). Il est en étroite liaison avec le plateau génomique.

Les analyses bio-informatiques incluent principalement :
  • les études transcriptomiques (RNASeq)
  • les analyses d’interactions ADN/protéines (ChipSeq)
  • des analyses génomiques de détection de polymorphismes (SNP calling).
  • l’analyse des lectures longues pour la détection de variations structurales et pour l’assemblage de génome de novo
D’autres analyses peuvent être développées à la demande, selon la disponibilité du plateau.

Au sein du bâtiment Bio-Environnement, un open space de 50 m² pouvant accueillir une dizaine de personnes permet la mise en place de groupes de travail bio-informatique au sein de l’université. Il permet également la formation en bio-informatique sous forme d’ateliers pour les personnels intéressés (étudiants, doctorants, post-doctorants, chercheurs, utilisateurs extérieurs, ...)
 
Bio-informatique
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Mise à jour le 25 mai 2022